খরগোশের রঙ ক্যালকুলেটর

পাঁচটি লোকাস কীভাবে কাজ করে

পোষা খরগোশের প্রতিটি রঙ তৈরি হয় মাত্র দুটি রঞ্জক (পিগমেন্ট) দিয়ে: ইউমেলানিন, যা কালো বা বাদামি, আর ফিওমেলানিন, যা হলুদ বা লাল। কোনো নীল রঞ্জক নেই, কোনো চকোলেট রঞ্জকও নেই। প্রজননকারীরা যাকে নীল বলেন, তা হল লোমের দণ্ডে কম ঘনত্বে জমা কালো রঞ্জক, আর যাকে লাইল্যাক বলেন, তা একইভাবে জমা চকোলেট। পাঁচটি প্রচলিত জিন-অবস্থান — যাদের লেখা হয় A, B, C, D ও E — ঠিক করে দুটির মধ্যে কোন রঞ্জক তৈরি হবে, কতটা জোরালোভাবে, আর প্রতিটি লোমের কোথায় বসবে। এই পাঁচটি ঠিকঠাক ধরতে পারলে মানদণ্ডে থাকা প্রায় প্রতিটি রঙের নাম বলে দেওয়া যায়।

প্রতিটি লোকাসে (জিন-অবস্থান) দুটি অ্যালিল থাকে, প্রতিটি প্যারেন্টের কাছ থেকে একটি করে, আর একটি লোকাসের ভেতরে অ্যালিলগুলোর একটি নির্দিষ্ট ক্রম থাকে। খরগোশ তার সবচেয়ে প্রকট অ্যালিলের ফিনোটাইপ দেখায় এবং অন্যটি নিঃশব্দে পরের প্রজন্মে পাঠিয়ে দেয়। খরগোশের জেনেটিক্স ক্যালকুলেটর কাজে লাগার পুরো কারণ এটাই: লুকোনো অ্যালিলটি প্রাণীর গায়ে দেখা যায় না, কিন্তু লিটারে পুরোপুরি উপস্থিত থাকে।

A লোকাস (ASIP জিন) প্রতিটি আলাদা লোমের প্যাটার্ন ঠিক করে। A অ্যাগুটি লোম দেয় — প্রতিটি লোমে প্রথমে গাঢ়, তারপর হলুদ, তারপর আবার গাঢ় ডোরা, আর হালকা পেট। at ট্যান প্যাটার্ন দেয়: শরীরে একরঙা লোম, আর উজ্জ্বল ট্যান বা ক্রিম রঙের পেট, চোখের চারপাশে বৃত্ত, নাকের পাশে রেখা আর কানের পেছনে একটি ত্রিভুজ। a হল সেলফ: চামড়া থেকে ডগা পর্যন্ত একটাই নিরেট রঙ। ক্রমটি হল A > at > a।

B লোকাস (TYRP1) বেছে নেয় কোন ইউমেলানিন তৈরি হবে — কালোর জন্য B, চকোলেটের জন্য b — আর D লোকাস (MLPH) ঠিক করে সেটি কতটা ঘন করে ভরা হবে। দুটি মিলে সেই চারটি ভিত্তি রঙ দেয় যার ওপর বাকি প্রতিটি রঙ গড়ে ওঠে: কালো (B_D_), নীল (B_dd), চকোলেট (bbD_) আর লাইল্যাক (bbdd)। দুটিই সরল, দুই-অ্যালিলের, সম্পূর্ণ প্রকট জিন।

C লোকাস (টাইরোসিনেজ) নিয়ন্ত্রণ করে এনজাইমটি আদৌ কতটা রঞ্জক তৈরি করতে পারবে, আর এর সিঁড়িটিই সবচেয়ে লম্বা: C > cchd > cchl > ch > c। পূর্ণ রঙ, তারপর চিনচিলা-ডার্ক, তারপর চিনচিলা-লাইট (শেডেড বা সেবল অ্যালিল), তারপর হিমালয়ান, তারপর অ্যালবিনো। চিনচিলা কাজ করে হলুদ রঞ্জক সরিয়ে দিয়ে: যে অ্যাগুটি খরগোশের হলুদ ডোরা সাদা হয়ে যায়, সে-ই চিনচিলা। হিমালয়ান হল এনজাইমের তাপ-সংবেদী রূপ, তাই পয়েন্টগুলো — কান, নাক, পা, লেজ — রঙিন হয় আর উষ্ণ শরীর হয় না, এবং তাই ঠান্ডায় বড় হওয়া হিমালয়ানের পয়েন্ট বেশি গাঢ় হয়। আর cc হল এপিস্ট্যাটিক: এটি সব রঞ্জক বন্ধ করে দেয়, তাই অ্যালবিনো খরগোশ বাকি চারটি লোকাস যা-ই বলুক, রুবি-চোখ সাদা (ruby-eyed white) হয়। সেগুলোর প্রতিটি তখনও আছে, তখনও পরের প্রজন্মে যাচ্ছে, আর পুরোপুরি অদৃশ্য।

E লোকাস (MC1R) ঠিক করে গাঢ় রঞ্জক লোম বরাবর কতদূর ছড়াবে। E হল স্বাভাবিক বিস্তার এবং A ও C-কে তাদের কাজ করতে দেয়। e, সমযুগ্মজ ee অবস্থায়, গাঢ় রঞ্জককে লোমে পৌঁছাতেই দেয় না, ফলে থেকে যায় কমলা, ফন বা টর্টয়েজ রঙ। ej — জাপানি ব্রিন্ডলিং — দুটি রঞ্জককে হার্লেকুইনের আলাদা আলাদা ছোপে ভাগ করে দেয়। Es হল স্টিল, একটি আংশিক বিস্তার যা ডগায় রঙিন গার্ড-লোম রেখে যায়, আর এটি কেবল সেই খরগোশেই দেখা যায় যে অ্যাগুটিও।

এক নজরে পাঁচটি লোকাস

খরগোশের জিনোটাইপ স্ট্রিং কীভাবে পড়বেন

জিনোটাইপ লেখা হয় লোকাসের ক্রমে পাঁচটি জোড়া হিসেবে, তাই aaBBCCDdEE-এর মানে: A-তে সেলফ, B-তে কালো, C-তে পূর্ণ রঙ, D-তে একটি ঘন আর একটি ডাইলিউট, E-তে স্বাভাবিক বিস্তার। সেই খরগোশটি কালো এবং ডাইলিউটের বাহক। আন্ডারস্কোর মানে “অজানা, আর এখানে তাতে কিছু যায় আসে না” — aaB_C_D_E_ লিখে বোঝানো হয় “এই খরগোশটি কালো, আর বাকিটা আমি প্রমাণ করিনি”। প্রথা অনুযায়ী প্রতিটি জোড়ার প্রকট অ্যালিলটি আগে লেখা হয়, তাই আপনি Dd দেখেন, কখনো dD নয়। ওপরের ক্যালকুলেটর দুই প্যারেন্টের স্ট্রিং তাদের ড্রপডাউনের নিচে লিখে দেয়, যাতে আপনি সেগুলো বংশতালিকায় (পেডিগ্রি) তুলে নিতে পারেন।

দুটি ছোট অভ্যাস জেনে রাখা ভালো। প্রজননকারীরা প্রায়ই সেই লোকাসগুলো বাদ দেন যেখানে বিশেষ কিছু ঘটছে না, আর ওপরের ডাইলিউট-বাহক কালোর জন্য লেখেন aaDd। আর টাইপ করা লেখায় সুপারস্ক্রিপ্ট প্রায়ই সমান করে ফেলা হয়, তাই at হয়ে যায় at, cchd হয়ে যায় cchd আর ej হয়ে যায় ej। দুটোই ঠিক আছে, যতক্ষণ বংশতালিকা যাঁরা পড়ছেন তাঁরা সবাই একমত।

একটি কষে দেখানো উদাহরণ, ধাপে ধাপে

ধরুন একটি কালো অটার মাদি, যে চকোলেট, ডাইলিউট আর অ্যালবিনোর বাহক — ata Bb Cc Dd Ee — তার সঙ্গে একটি চেস্টনাট পুরুষ, যে সেলফ, চকোলেট আর ডাইলিউটের বাহক কিন্তু অ্যালবিনোর নয়: Aa Bb CC Dd Ee। ক্যালকুলেটরে ডিফল্ট হিসেবে এই ক্রসটিই লোড হয়, তাই এই সংখ্যাগুলো আপনি টুলটি দিয়েই মিলিয়ে দেখতে পারেন। এ থেকে 18টি আলাদা রঙ হয়। সবচেয়ে সম্ভাব্য পাঁচটি হল:

বাকি তেরোটি নিচের দিকে নামে — 7.03%-এ চকোলেট অ্যাগুটি (অ্যাম্বার) আর টর্টয়েজ, তারপর ডাইলিউট ও চকোলেট অটার, ফন, লাইল্যাক অ্যাগুটি (লিংক্স), আর শেষে 0.78%-এ লাইল্যাক টর্টয়েজ — সেই বাচ্চা, যার একসঙ্গে B, D আর E তিনটি থেকেই প্রচ্ছন্ন অ্যালিল দরকার। লক্ষ করুন কী নেই: কোনো রুবি-চোখ সাদা নেই, কারণ পুরুষটি CC এবং অ্যালবিনো অ্যালিল দিতেই পারে না, তাই মাদির c জোড়া বাঁধার মতো কিছু পায় না। একজন প্যারেন্ট কোনো প্রচ্ছন্ন অ্যালিল থেকে মুক্ত হলে সেই রঙটি লিটার থেকে পুরোপুরি বাদ পড়ে।

দুটি কালো খরগোশ থেকে কেন নীল বাচ্চা হতে পারে

এই প্রশ্নটিই বেশিরভাগ মানুষকে প্রথমবার খরগোশ প্রজননের রঙ ক্যালকুলেটর খুঁজতে পাঠায়, আর এর উত্তর D লোকাস। ডাইলিউট প্রচ্ছন্ন। Dd খরগোশ ঠিক ততটাই কালো দেখায় যতটা DD — একটি ঘন অ্যালিলই পূর্ণ ঘনত্বের লোমের জন্য যথেষ্ট, আর দেখে বোঝার কোনো চিহ্ন নেই। দুটি Dd কালো খরগোশের প্রজনন করালে প্রতিটি বাচ্চার দুই প্যারেন্টের কাছ থেকেই d পাওয়ার সম্ভাবনা চারে এক। সেই বাচ্চাটি dd, আর সে নীল।

“ডাইলিউট-বাহক দুটি কালো” প্রিসেটটি লোড করুন, টুলটি ঠিক 75% কালো আর 25% নীল দেখাবে। এই একই যুক্তি এই শখের প্রতিটি চমকের পেছনে: দুটি কালো থেকে চকোলেট (দুজনেই b বহন করছিল), দুটি রঙিন প্যারেন্ট থেকে রুবি-চোখ সাদা (দুজনেই c বহন করছিল), দুটি কালো থেকে কমলা (দুজনেই e বহন করছিল)। একটি প্রচ্ছন্ন অ্যালিল প্রজন্মের পর প্রজন্ম নিঃশব্দে চলতে পারে, আর কেবল তখনই নিজেকে জানান দেয় যখন নিজেরই আরেকটি কপির সঙ্গে দেখা হয়।

রঙ, প্যাটার্ন, আর খরগোশের রঙের চার্ট আসলে কী তালিকা করে

ছাপা খরগোশের রঙের চার্ট সাধারণত দুটি আলাদা জিনিস মিশিয়ে ফেলে। বেশিরভাগ সারি হল রঙ — কালো, নীল, চকোলেট, লাইল্যাক, চেস্টনাট, ওপাল, চিনচিলা, হিমালয়ান, রুবি-চোখ সাদা — আর ঠিক এগুলোই ওপরের পাঁচটি লোকাস নির্ধারণ করে। কয়েকটি সারি হল প্যাটার্ন: ব্রোকেন, ডাচ, ইংলিশ স্পটিং, ব্যান্ডেড। প্যাটার্ন বোঝায় শরীরে সাদা কীভাবে ছড়িয়ে আছে, আর এগুলো নিয়ন্ত্রণ করে সম্পূর্ণ আলাদা জিন, প্রধানত En লোকাসের স্পটিং জিন।

এরা একে অপরের সঙ্গে প্রতিযোগিতা করে না, বরং একটির ওপর আরেকটি যোগ হয়। একটি ব্রোকেন কালো হল একটি কালো খরগোশ — aaB_C_D_E_, পাঁচটি লোকাসই ওপরের মতো — যে স্পটিং অ্যালিলের একটি কপিও বহন করে। রঙের জিনগুলো ঠিক করে রঙিন ছোপগুলো কোন রঙের হবে; প্যাটার্নের জিন ঠিক করে সেগুলো কোথায় থাকবে। সেই কারণেই শো-এর মানদণ্ডে দুটির নাম একসঙ্গে থাকে: “ব্রোকেন চেস্টনাট”, “ব্রোকেন টর্টয়েজ”। এর মানে এটাও যে রঙের ক্যালকুলেটর আর প্যাটার্নের ক্যালকুলেটর আলাদা প্রশ্নের উত্তর দেয়, আর এই ক্যালকুলেটর রঙের প্রশ্নের উত্তর দেয়।

এই ক্যালকুলেটর যা বলতে পারে না

চালাক দেখানোর চেয়ে সীমানা নিয়ে স্পষ্ট থাকা বেশি জরুরি, তাই এই রইল সৎ তালিকা।

• ব্রোকেন আর চার্লি। En স্পটিং লোকাস এখানে মডেল করা হয়নি। Enen হল সাধারণ ব্রোকেন, EnEn খুব সামান্য রঙ থাকা চার্লি, enen নিরেট একরঙা — এটি একটি আলাদা স্কোয়ার, যা আপনি এটির পাশাপাশি চালাবেন।
• ওয়াইডব্যান্ড ও রুফাস মডিফায়ার। অ্যাগুটি বা কমলার ওপর লালের গাঢ়ত্ব ঠিক করে বহুজিনীয় মডিফায়ার, যাদের কোনো পরিষ্কার অ্যালিল-চিহ্ন নেই। ফ্যাকাশে ফন আর গাঢ় লালের তফাত এদের কারণেই, আর কোনো পাঁচ-লোকাস মডেল এগুলো আগে থেকে বলতে পারে না।
• সিলভারিং, ভিয়েনা ও ডোয়ার্ফ জিন। সিলভারিংকে এখনও কোনো শনাক্ত জিনের সঙ্গে যুক্তই করা যায়নি। নীল-চোখ সাদার পেছনের ভিয়েনা জিন, আর সেই ডোয়ার্ফ জিন যা সমযুগ্মজ বাচ্চাকে বাঁচতে-না-পারা “পিনাট”-এ পরিণত করে, দুটিই এই ব্যবস্থার পুরোপুরি বাইরে।
• শেড গ্রেডিং। সেবল, সিল আর স্মোক পার্ল যতটা জিনোটাইপে আলাদা, ততটাই গাঢ়ত্বের মাত্রায়, আর একই জুটিকে দুটি জাতে আলাদাভাবে বিচার করা হতে পারে।
• প্রাণীদের নিজেদের সম্পর্কে যেকোনো কিছু। কেবল প্রতি বাচ্চার সম্ভাবনা, এর বেশি কিছু নয় — না লিটারের আকার, না স্বাস্থ্য, না কল্যাণ।

যেখানে সূত্রগুলো একমত নয়, আর আমরা কী বেছে নিয়েছি

শৌখিনদের চার্ট সবচেয়ে বেশি পরস্পরবিরোধী হয় C ও E লোকাসে, তাই এই টুল কোন ব্যাখ্যাটি প্রয়োগ করে আর মতভেদটা কোথায়, তা স্পষ্ট করে বলা দরকার।

E লোকাসে চারটি নয়, পাঁচটি অ্যালিল। বহু প্রজননকারীর পাতা Es > E > ej > e লিখে থেমে যায়। OSU Extension-এর লেখা আর খরগোশের MC1R জিন নিয়ে আণবিক গবেষণা, দুটিই একটি পঞ্চম ও আরও প্রকট অ্যালিলের কথা বলে, Ed, প্রকট কালো — বিরল, কিন্তু বাস্তব, এবং F₁ ও F₂ পরিবারে পৃথকীকরণ দিয়ে নিশ্চিত। আমরা এটি রেখেছি, বিরল হিসেবে চিহ্নিত করে, আর ডিফল্টে বন্ধ রেখেছি।

শেডেড অ্যালিলটি অন্যগুলোর চেয়ে কম নিশ্চিত। OSU স্পষ্ট বলে যে cchl-এর অস্তিত্ব আর সেবল ফিনোটাইপের সঙ্গে তার সম্পর্ক “অনুমান করা হয়েছে, কিন্তু DNA প্রমাণ দিয়ে নিশ্চিত হয়নি”। আমরা অ্যালিলটি রেখেছি কারণ প্রজননকারীরা সেবল আর সিল আসলে এভাবেই নথিভুক্ত করেন, কিন্তু যেকোনো cchl ফলকে এই পাতার সবচেয়ে কম সমর্থিত আউটপুট হিসেবে ধরি।

একটি ইচ্ছাকৃত ব্যতিক্রম। OSU-র লেখায় বলা আছে Ed রঙটি B ও D থেকে নির্ধারণ করে “A ও C জিনোটাইপ যা-ই হোক (cc ছাড়া)”। আমরা এটি A লোকাসে প্রয়োগ করি, কিন্তু ch-এ নয়: C-সিরিজের অ্যালিলগুলো খোদ টাইরোসিনেজ এনজাইমের মিউটেশন, তাই হিমালয়ান পুরো শরীরের রঞ্জক তৈরিই করতে পারে না, MC1R জিন তার জন্য যত জোরেই সংকেত দিক। আমরা এই ব্যতিক্রম চাপা না দিয়ে স্পষ্ট জানাচ্ছি — আপনি যদি কঠোরভাবে প্রকাশিত লেখা মেনে কাজ করেন, তবে Ed_ chch ফলটিকে বিতর্কিত হিসেবে পড়ুন।

প্রায়শই জিজ্ঞাসিত প্রশ্ন

আমার খরগোশের বাচ্চাগুলো কোন রঙের হবে?

এর কোনো একক উত্তর নেই — একটি লিটার (একবারে জন্মানো বাচ্চারা) হল একটি সম্ভাবনা-বণ্টন, একটি রঙ নয়। ওপরের পাঁচটি লোকাসে দুই প্যারেন্টের অ্যালিল দিন, আর ক্যালকুলেটর সেই ক্রস থেকে সম্ভব প্রতিটি বাচ্চার রঙ তার সঠিক শতাংশসহ তালিকা করে দেবে। যদি শুধু জানেন বাবা-মা দেখতে কেমন, তবুও পরিসর ছোট করা যায়: খরগোশের চেহারা তার প্রকট অ্যালিলগুলো নির্দিষ্ট করে, কিন্তু সে যে প্রচ্ছন্ন অ্যালিল বহন করে সেগুলো লুকিয়ে রাখে, তাই দৃশ্যমান রঙ থেকে শুরু করে প্রতিটি সম্ভাব্য লুকোনো অ্যালিল একে একে চেষ্টা করুন।

সাধারণ খরগোশ পানেট স্কোয়ার ক্যালকুলেটর থেকে এটি কীভাবে আলাদা?

পানেট স্কোয়ার একবারে একটি লোকাস সামলায়। খরগোশের রঙের জন্য পাঁচটিই একসঙ্গে লাগে, আর লোকাসগুলো একে অপরকে প্রভাবিত করে — cc অন্য প্রতিটি জিনকে লুকিয়ে ফেলে, ee সেই গাঢ় রঞ্জক সরিয়ে দেয় যা A লোকাস সাজাচ্ছিল, আর স্টিল কেবল অ্যাগুটি খরগোশেই দেখা যায়। এই টুল পাঁচটি স্কোয়ারই চালায়, স্বাধীন ফলগুলো গুণ করে একটি যৌথ বণ্টন তৈরি করে, তারপর সেই পারস্পরিক-ক্রিয়ার নিয়মগুলো প্রয়োগ করে সেই রঙের নাম দেয় যা একজন প্রজননকারী সত্যিই বংশতালিকায় লিখবেন।

শতাংশগুলো আমার আগের লিটারের সঙ্গে মেলে না কেন?

শতাংশ বোঝায় প্রতি বাচ্চার সম্ভাবনা, লিটারের নিশ্চিত ভাগ নয়। ছয় বাচ্চার লিটারে 25% সম্ভাবনা থেকে সাধারণত এক বা দুটি বাচ্চা আসে, কিন্তু শূন্য আর ছয় দুটোই পুরোপুরি সম্ভব। প্রতিটি নিষেক একটি স্বাধীন ড্র, আর যে মাদি খরগোশ পরপর চারটি কালো বাচ্চা দিয়েছে, পরের বার তার নীল বাচ্চা দেওয়ার সম্ভাবনা একটুও বেশি নয়।

বানি রঙ ক্যালকুলেটর কি ছবি দেখে জিনোটাইপ বলতে পারে?

না, আর একজন অভিজ্ঞ বিচারকও পারেন না। চেহারা আপনাকে প্রতিটি লোকাসের প্রকট অ্যালিলটি জানায়, দ্বিতীয়টি সম্পর্কে কিছুই না। একটি কালো খরগোশ হল aaB_C_D_E_ — আন্ডারস্কোরগুলো সত্যিই অজানা, যতক্ষণ না আপনি টেস্ট-ব্রিডিং করেন, তার বংশতালিকা দেখেন, বা বাণিজ্যিক লোমের-রঙ জিনোটাইপিংয়ের জন্য নমুনা পাঠান।

আমি ব্রিটিশ বানানের “rabbit colour calculator” খুঁজেছিলাম — এটা কি একই জিনিস?

হ্যাঁ। “Rabbit color calculator” আর “rabbit colour calculator” একই টুল; ইংরেজি পাতায় আমরা আমেরিকান বানান ব্যবহার করি কারণ আমাদের বেশিরভাগ পাঠক সেখানেই, আর জেনেটিক্স দুই ক্ষেত্রেই একই। দেশ থেকে দেশে শুধু রঙের নামগুলো বদলায়। একই খরগোশ রেক্স জাতে ক্যাস্টর, নেদারল্যান্ড ডোয়ার্ফে চেস্টনাট অ্যাগুটি, আর ইউরোপের বড় অংশে কেবল অ্যাগুটি। যেখানে দুটি নামই প্রচলিত, আমরা দুটোই দেখাই, কিন্তু কোনো খরগোশকে শো-তে নামানোর আগে সবসময় নিজের ক্লাবের মানদণ্ড মিলিয়ে নিন।

সূত্র

• খরগোশের লোমের রঙের পেছনের জেনেটিক্স বোঝা: পর্ব 1 — ভূমিকা — Oregon State University Extension Service, EM 9707 (Stern & Cruickshank, 2022), বিশেষজ্ঞ-পর্যালোচিত। প্রকটতা, অ্যালিল আর দুটি রঞ্জক।
• পর্ব 2 — লোমের রঙের জিন — ওপরে প্রয়োগ করা পাঁচটি লোকাসের অ্যালিল-তালিকা ও প্রকটতার ক্রম, সঙ্গে স্পটিং ও সিলভারিং জিন, যেগুলো আমরা ইচ্ছে করে বাদ রেখেছি।
• পর্ব 3 — আপনার খরগোশ — চোখের সামনের খরগোশ থেকে উল্টো দিকে এগিয়ে সেই জিনোটাইপে পৌঁছানো, যা আপনি এই ক্যালকুলেটরে দেবেন।
• Fontanesi et al., খরগোশের জাপানি ব্রিন্ডলিং লোমের রঙের সঙ্গে যুক্ত MC1R জিনের ছয় bp-র যৌগিক ইন-ফ্রেম বিলোপন, BMC Genetics — পাঁচ-অ্যালিলের এক্সটেনশন সিরিজ ও তার প্রকটতার ক্রমের স্বাধীন নিশ্চিতকরণ।

সম্পর্কিত টুল

• শতাংশ ক্যালকুলেটর
• ঐকিক নিয়ম (রুল অফ থ্রি) ক্যালকুলেটর
• র‍্যান্ডম নম্বর জেনারেটর
• সব টুল